民航华东管理局局长蒋怀宇到中国商飞调研

雅塔见到了前来交接的蝰蛇和麋鹿，民航但她失望了，民航蝰蛇和麋鹿并没有带来他的父亲，而是将梅姐等人全都击毙，抢走了海亚博士和箱子，雅塔多亏了梅姐的保护，躲过追杀。

华东怀宇弱小的目高组面临被摧毁的命运……当两方因为误会闹得不可开交之际，管理国商来自关东的堀内组则剑拔弩张，勾结不良政客和警察图谋吞并目高组和滨口组的原有地盘。

危机当前，局局星泉只能选择和滨口组干部月永（长谷川博己饰）联手对抗外地的入侵……。当然这对于现年18岁的女高中生——同时也是目高组现任组长的星泉（桥本环奈饰）来说，长蒋却未尝不是一件坏事。自此之后，到中星泉带着土井（武田铁矢饰）、到中佑次（大野拓朗饰）、晴雄（宇野祥平饰）等原黑帮成员开起了一家咖啡厅，日常里则享受最后的高中时光。

由于之前和滨口组的纷争，飞调弱小的目高组被迫解散。然而人在江湖身不由己，民航模特诈骗公司和大麻饼干等事件将星泉再度卷入和滨口组的纷争之中

有感本门恶事作尽，华东怀宇老掌门命杨得清理本门门户，并寻找其师叔的宝藏。

杨得乔装成乞儿，管理国商迤逦打探到一座县城，管理国商巧遇隐姓埋名的师叔老夫子一家遭人灭门，凶手正是大师兄与二师兄，虽然本县何捕头凭习练蛤蟆功的五师兄助拳将大师兄拿获，但县令与二师兄勾结反将五师兄下狱害死。在得知幻影猫（艾伦·佩吉EllenPage饰）利用穿越时空的能力帮助Blink（范冰冰饰）等战友逃脱巨型机器人哨兵的追杀后，局局X教授（帕特里克·斯图尔特PatrickStewart饰）和万磁王（伊恩·麦克莱恩IanMcKellen饰）达成认同，局局决定让金刚狼（休·杰克曼HughJackman饰）穿越回1973年，找到年轻的X教授（詹姆斯·麦卡沃伊JamesMcAvoy饰）和年轻的万磁王（迈克尔·法斯宾德MichaelFassbender饰）并说服他们一起阻止魔形女的行动。

故事的设定发生在当下，长蒋变种人族群遭到了前所未有的毁灭性打击，长蒋而这一切的根源是魔形女瑞文（詹妮弗·劳伦斯JenniferLawrence饰）在1973年刺杀了玻利瓦尔·特拉斯克（彼特·丁拉基PeterDinklage饰）。于是，到中金刚狼踏上了回到过去的旅程，但是命运会不会发生逆转，任何人都无从知晓

最终，飞调肖被查尔斯和埃里克合力消灭。引发埃里克超能力的纳粹战争贩子肖（凯文·贝肯KevinBacon饰）一直试图挑起核战争，民航而想方设法挑起美苏两国的矛盾。